Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC28Q96AY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC28Q96AY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC28Q96AY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms