Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF148Q8N7C7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms