Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca8Q8BHX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdca8Q8BHX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms