Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms