Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSNAXIP1Q2TAA8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.5 ms