Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SQSTM1Q13501 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SQSTM1Q13501 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQSTM1Q13501 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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