Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK2Q13002 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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