Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 DPM1YPR183W 804 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MSS2YDL107W 1056 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RNA15YGL044C 891 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 CBF1YJR060W 1056 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 NYV1YLR093C 762 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SUB1YMR039C 879 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YOL099CYOL099C 492 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 ADH5YBR145W 1056 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 LDB16YCL005W 771 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MDM31YHR194W 1740 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 EDC3YEL015W 1656 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 TGL1YKL140W 1647 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 OPT1YJL212C 2400 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YJL045WYJL045W 1905 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MPO1YGL010W 525 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 COS8YHL048W 1146 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 PRP21YJL203W 843 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YAL045CYAL045C 309 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MRPL13YKR006C 795 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 AIF1YNR074C 1137 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 GFA1YKL104C 2154 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 EUG1YDR518W 1554 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SLA2YNL243W 2907 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YDL027CYDL027C 1263 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RPT3YDR394W 1287 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YDR476CYDR476C 675 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 EDC2YER035W 438 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 PRP38YGR075C 729 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YLL037WYLL037W 381 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SUR7YML052W 909 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YML119WYML119W 1074 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YNR014WYNR014W 639 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RPB8YOR224C 441 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YOR292CYOR292C 930 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 OPI11YPR044C 354 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 DFG5YMR238W 1377 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SPR3YGR059W 1539 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 PMT3YOR321W 2262 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 GRH1YDR517W 1119 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SPO74YGL170C 1242 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YHB1YGR234W 1200 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 AIM18YHR198C 966 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SPO7YAL009W 780 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 SRP21YKL122C 504 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YAR069CYAR069C 294 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MRPL16YBL038W 699 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RBD2YPL246C 789 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MUD1YBR119W 897 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 TUF1YOR187W 1314 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YCR061WYCR061W 1896 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 PAC2YER007W 1557 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 HMLALPHA2YCL067C 633 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MATALPHA2YCR039C 633 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 NSE4YDL105W 1209 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 NRG1YDR043C 696 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 TGL2YDR058C 981 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MOB2YFL034C-B 864 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 MHT1YLL062C 975 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 NIT3YLR351C 876 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 NOP13YNL175C 1212 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 HNT3YOR258W 654 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 RAD7YJR052W 1698 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 FDC1YDR539W 1512 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YNR066CYNR066C 1311 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HEL1YKR017C 1656 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PDS1YDR113C 1122 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RML2YEL050C 1182 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YGL132WYGL132W 336 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YGR015CYGR015C 987 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PFS1YHR185C 714 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YIL089WYIL089W 618 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YJL068CYJL068C 900 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YML122CYML122C 381 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RPC19YNL113W 429 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YOR283WYOR283W 693 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HUA2YOR284W 732 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SUR1YPL057C 1149 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PRD1YCL057W 2139 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HXT7YDR342C 1713 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HXT6YDR343C 1713 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HOS1YPR068C 1413 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 ATP16YDL004W 483 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PLP1YDR183W 693 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 BGL2YGR282C 942 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SDS3YIL084C 984 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SIC1YLR079W 855 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YNL050CYNL050C 813 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YOL118CYOL118C 309 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 GSP2YOR185C 663 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 ARO4YBR249C 1113 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SES1YDR023W 1389 nt6.26□□□□□ -1.41
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