Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSX2P58304 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSX2P58304 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSX2P58304 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSX2P58304 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSX2P58304 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSX2P58304 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VSX2P58304 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSX2P58304 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSX2P58304 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSX2P58304 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSX2P58304 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms