Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP1P56182 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP1P56182 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP1P56182 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RRP1P56182 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RRP1P56182 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RRP1P56182 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP1P56182 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP1P56182 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP1P56182 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP1P56182 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRP1P56182 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRP1P56182 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRP1P56182 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRP1P56182 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RRP1P56182 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRP1P56182 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRP1P56182 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP1P56182 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP1P56182 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP1P56182 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP1P56182 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP1P56182 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP1P56182 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRP1P56182 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRP1P56182 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRP1P56182 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP1P56182 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP1P56182 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP1P56182 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRP1P56182 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRP1P56182 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP1P56182 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP1P56182 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP1P56182 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP1P56182 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP1P56182 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP1P56182 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP1P56182 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP1P56182 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP1P56182 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP1P56182 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms