Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D1P54289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms