Protein–RNA interactions for Protein: P53568

Cebpg, CCAAT/enhancer-binding protein gamma, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpgP53568 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CebpgP53568 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpgP53568 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CebpgP53568 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CebpgP53568 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CebpgP53568 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms