Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX1P52954 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX1P52954 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX1P52954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX1P52954 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX1P52954 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX1P52954 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LBX1P52954 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX1P52954 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX1P52954 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX1P52954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX1P52954 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX1P52954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX1P52954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX1P52954 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX1P52954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX1P52954 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX1P52954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX1P52954 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX1P52954 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX1P52954 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX1P52954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX1P52954 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX1P52954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX1P52954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX1P52954 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX1P52954 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX1P52954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX1P52954 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX1P52954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX1P52954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX1P52954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX1P52954 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LBX1P52954 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX1P52954 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX1P52954 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX1P52954 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LBX1P52954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX1P52954 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX1P52954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LBX1P52954 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX1P52954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LBX1P52954 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms