Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCP4P48539 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCP4P48539 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCP4P48539 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCP4P48539 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCP4P48539 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCP4P48539 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCP4P48539 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCP4P48539 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCP4P48539 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms