Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM18P0DKX4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM18P0DKX4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms