Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPSAP08865 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPSAP08865 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPSAP08865 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPSAP08865 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPSAP08865 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPSAP08865 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPSAP08865 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPSAP08865 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPSAP08865 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPSAP08865 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPSAP08865 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPSAP08865 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPSAP08865 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPSAP08865 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPSAP08865 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPSAP08865 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPSAP08865 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPSAP08865 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPSAP08865 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPSAP08865 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPSAP08865 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms