Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06330 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06330 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06330 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06330 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06330 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06330 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06330 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06330 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06330 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06330 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06330 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06330 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06330 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P06330 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06330 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06330 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06330 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06330 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06330 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms