Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG5P05408 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG5P05408 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG5P05408 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG5P05408 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG5P05408 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG5P05408 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG5P05408 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG5P05408 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG5P05408 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG5P05408 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG5P05408 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCG5P05408 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCG5P05408 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCG5P05408 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCG5P05408 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCG5P05408 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCG5P05408 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCG5P05408 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCG5P05408 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCG5P05408 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCG5P05408 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms