Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNKO75909 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNKO75909 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNKO75909 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNKO75909 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNKO75909 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNKO75909 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNKO75909 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNKO75909 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNKO75909 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNKO75909 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNKO75909 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNKO75909 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNKO75909 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNKO75909 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNKO75909 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNKO75909 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNKO75909 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNKO75909 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNKO75909 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms