Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX6Q9UPM6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms