Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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