Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms