Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FYCO1Q9BQS8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms