Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PITX2Q99697 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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