Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms