Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC141Q6ZP82 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms