Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms