Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms