Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms