Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms