Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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