Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms