Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms