Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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