Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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