Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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