Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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