Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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