Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFEMP1Q12805 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFEMP1Q12805 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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