Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms