Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms