Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms