Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms