Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIG1P18858 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms