Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms