Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLBP06746 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLBP06746 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLBP06746 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms