Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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