Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3AO14802 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3AO14802 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3AO14802 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms