Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA2O00451 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms