Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms